Никольский храм был построен немецким архитектором Шацким в центре села. Этим же архитектором был построен и Покровский храм, а также несколько зданий в селе. Храм входит в третий благочиннический округ Астраханско-Енотаевской Епархии.
Раньше на этом месте находилась старая церковь, которую начали ломать в 1890 году. В архивах Саратовской палаты государственных Имуществ о первой церкви сказано: «…церковь во имя Святителя Чудотворца Николая построена в 1817 году иждивением прихожан зданием каменным, с таковою же колокольнею. Жалования священнослужители не имеют, пользуются доброхотным подаянием…».
Часть кирпича пошла на строительство нового храма, остальной кирпич был заказан на местном заводе. В 1895 году, предположительно 22 мая по новому стилю, Никольский храм был освящён. Стало быть, зданию Никольского храма постройки 1895 года в 2010 исполнилось 115 лет, а со дня основания и начала богослужения с 1817 года в 2012 году исполнилось 195 лет.
Рядом с новым Никольским храмом построили высокую двухъярусную колокольню, не менее 50 метров в вышину. На верхнем этаже находилось около 2-х десятков малых колоколов и один большой. В них звонили всегда по положению церковного устава при выпуске из обедни, в «царские» дни при погребении богатых людей и священнослужителей. На нижнем этаже был подвешен огромнейший колокол, который был привезён в Капустин Яр летом 1895 года на пароходе, а с пристани «богатыря» на санях привезли к колокольне и с большим трудом водрузили.
В него звонили по большим праздникам, а также в пургу и буран. Звон этого колокола был слышен за 25 км и был настолько силён, что на расстоянии 200 метров от него невозможно было разговаривать.
Новый храм вмещал в себя 2 тысячи человек. В Никольской церкви был паркетный пол и богато убранный алтарь. Все иконы и подсвечники были отделаны под золото. В храме было много золотых чаш и крестов, богаты были парчовые одеяния священников. По воскресеньям крестьяне собирались в церкви для того, чтобы помолиться и послушать проповедь священника.
Во время советской власти все церкви в селе были разрушены. Никольский храм уцелел благодаря тому, что по решению властей в нем был образован клуб. Перед этим из церкви были вынесены все иконы, часть из них разобрали по домам сельчане.
В дни разгрома церкви с неё были сброшены колокола, красивый металлический забор, окружавший двор, убрали и заменили штакетником, сторожка и три школы в храмовом дворике были разрушены. Несмотря на это, здание оставалось святым для верующих, которые надеялись, что храм будет возвращен Церкви. Эта надежда окрепла с выходом постановления «О передаче культовых сооружений Церкви».
Возвращение единственного уцелевшего храма Святого Николая верующим в январе 1992 года в селе Капустин Яр, его освящение и благословение на богослужение епископа Астраханского и Енотаевского Владыки Ионы 5 мая 1995 года стало временем пробуждения от господствовавшего семь десятилетий атеистического мышления и святотатства. Церковь стала свободной.
Православный журнал «Русь Святая, храни веру православную»
Только Астраханско-Енотаевской епархии больше нет, а есть Ахтубинско-Енотаевская.